• La actividad de transporte maritimo, exceptuando el que se lleve a cabo exclusivamente entre puertos y puntos de una misma Comunidad Auronoma, que tenga competencias en la materia, sin conexión con puertos o puntosde otros ambitos territoriales.
• La ordenación y el control de la flota civil española.
• La Seguridad en la navegación y de la Vida Humana en la Mar.
• La Seguridad Marítima, incluyendo la habilitación para el ejercicio de practicaje y la determinación de los servicios de remolque portuario, asi como la disponbilidad de ambos en  caso de emergencia.
• El Salvamento Maritimo, en los terminos previstos en la RD legistlativo 2/2011  de la Ley de Puertos del Estado y de la Marina Mercante.
• La prevención de contaminación producida desde buques, plataformas fijas y otras instalaciones que se encuentren en aguas situadasen zonas en la que España ejerce soberanía, derechos soberanos o jurisdicción y la protección del medio ambiente marino.
• La inspeccion técnica y operativa de buques, titulaciones y mercancías.
• La ordenación del tráfico y las comunicaciones marítimas
• El control de situación, abanderamiento y registro de buques civiles, asi como su despacho sin perjuicio de las preceptivas autorizaciones previas que correspondan a otras Autoridades.
• La garantía del cumplimiento de las obligaciones en materia de defensa nacional y protección civil en la mar.
• Cualquier otro servicio maritimo atribuido a la Adminstración regulada en el Captitulo III del RD legistlativo 2/2011  de la Ley de Puertos del Estado y de la Marina Mercante.

No entra dentro de las competencias de la DGMM aquella relacionada con la actividad de la flota pesquera y la ordenación del sector pesquero asi como la actividad inspectora que corresponde al Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación.